Устройство файловой системы linux очень сильно отличается от устройства в windows. Для начала, в линуксе нет дисков C или D. Один физический диск (или несколько) при установке системы разбивается на каталоги и подкаталоги. Основной, корневой каталог обозначается символом / (слэш) Вместо файла подкачки существует отдельный раздел /swap. Каждый каталог можно форматировать в нужную файловую систему, в зависимости от задач пользователя. Например Ext3, ReiserFS, JFS или другую.
В разных дистрибутивах линукс схема и назначение некоторых каталогов может несколько отличаться.
Можно создавать свои каталоги. У меня на отдельном жестком диске находится каталог с фильмами. В корневом разделе он выглядит как /films.

Описание основных каталогов и подкаталогов в linux:
/bin — В нем находятся основные файлы команд.

/boot — В этом каталоге находится загрузчик системы (Grub или Lilo) и файлы, необходимые для загрузки системы.

/dev - В каталоге dev размещаются файлы описания устройств компьютера. В linux все устройства считаются файлами. Даже порты, диски, принтеры - все файл.

/etc - Каталог, в котором находятся конфигурационные файлы системы, программ, стартовые сценарии.
/etc/rc.d - файлы команд, запускающие приложения при загрузке системы.
/etc/passwd - в файле зашифрованы все данные о пользователях.
/etc/fstab - в файле содержится информация о файловых системах, автоматически монтируемых при запуске системы

/home - Пользовательский, домашний каталог. В linux может быть множество пользователей. Каждый пользователь имеет свой каталог.(например /home/user) В нем находятся любые файлы пользователей к которым он имеет непосредственный доступ записи/удаления. Также в домашнем каталоге находятся пользовательские программы, настройки. Их имена начинаются на точку и выглядят, к примеру, вот так - .kde .fonts

/lib - Здесь находятся различные библиотеки системы, модули ядра
/lib/firmware - несвободные модули ядра с закрытой лицензией
/lib/modules - подгружаемые модули ядра. Например драйверы устройств, файловых систем.

/mnt - В этот каталог временно монтируются различные подключаемые устройства. Флешки, дискеты, диски

/opt - В каталог устанавливаются дополнительные пакеты программ.

/proc - Каталог с виртуальной файловой системой. В нем, в виде файлов содержится информация о происходящих в системе процессах.
/proc/modules - в этом файле находится информация о списке загруженных модулей ядра.
/proc/cpuinfo - подробная информация о процессоре.
/proc/meminfo - информация об оперативной памяти.
/proc/devices - драйверы устройств встроенных в ядро системы.
/proc/uptime - информация про uptime системы. Т.е. Время работы без перезагрузки.
/proc/version - версия используемого системой ядра linux.
Все эти данные можно выводить в консоли с помощью команды cat.
Например cat /proc/cpuinfo

/root - Домашний каталог администратора(суперпользователя) системы. Используется администратором в случае если основной каталог home по каким-то причинам недоступен.

/sbin - Тут находятся основные программы выполняемые root.

/tmp - Каталог для временного хранения данных программами.

/usr - Основной каталог для установки программ. Кроме программ, в нем находятся файлы документации, исходные коды программ, ядра.
/usr/local - в этом каталоге находятся отдельно устанавливаемые пакеты программ.
/usr/src - исходники установленных программ и ядра.
/usr/man - файлы руководств к установленным программам.
/usr/lib - неизменяемые конфигурационные файлы и данные программ.

/var - В каталоге var находятся данные которые часто меняются в процессе работы системы. Например логи, кэши программ.
/var/local - изменяемые данные программ, установленных администратором в /usr/local.
/var/log - логи различных системных программ.
/var/run - временные файлы. Информация в них хранится до очередной перезагрузки системы.
/var/tmp - каталог для временных файлов.

Что еще можно почитать:

• Установка программ в ubuntu через консоль (27)
• Права доступа к файлам и каталогам (2)
• Описание популярных файловых систем linux (0)
• Команды linux для работы с файловой системой (5)
• Как удалить неудаляемые файлы из корзины (0)